Sự kiện có sự tham gia của khoảng 300 học sinh, giáo viên, quan sát viên từ 80 quốc gia, vùng lãnh thổ. Trường ĐH Khoa học tự nhiên thuộc ĐH Quốc gia Hà Nội được giao trách nhiệm phối hợp với Trường ĐH Sư phạm Hà Nội tổ chức. Đây là lần đầu tiên Bộ GD-ĐT giao cho một trường ĐH tổ chức kỳ thi Olympic quốc tế.
Tính đến nay, ban chuyên môn đã chuẩn bị được ngân hàng đề thi gồm 30 đề thực hành và 100 đề lý thuyết. Đề thi bảo đảm chất lượng, đã qua phần phản biện được thực hiện bởi các chuyên gia trong và ngoài nước; tất cả các bộ đề thi đã được đưa lên trang chủ chính thức của ICHO 46 để các nước tham khảo, biết được nội dung và độ khó. Bộ đề thi chính thức gồm 8 bài lý thuyết và 3 bài thực hành, sẽ được hoàn thành, dịch ra tiếng Anh và giữ bí mật cho tới thời điểm thi.