Về giám sát cũng có sự thay đổi, cụ thể là đối với các địa phương có dịch lây lan trong cộng đồng, chỉ giám sát các chùm ca bệnh, xét nghiệm các ổ dịch mới, các đối tượng có nguy cơ tử vong cao (trẻ dưới 5 tuổi, người già trên 65, phụ nữ có thai, người mắc bệnh mạn tính), các trường hợp có biến chứng để phục vụ công tác điều trị hoặc nghiên cứu theo dõi sự biến đổi của virus.
Mẫu bệnh phẩm chỉ được lấy theo chỉ định của bác sĩ để phục vụ công tác nghiên cứu, điều trị, không làm theo yêu cầu của người bệnh. Trường hợp bệnh nhân có triệu chứng lâm sàng điển hình, cần thực hiện điều trị theo phác đồ, không nhất thiết phải xét nghiệm.