Đầu tiên phải kể tới các đại biểu của bóng đá Sài Gòn. Sau khi đoạt Cúp quốc gia lần cuối năm 2000, đến năm 2004 CSG đổi tên thành TMN.CSG trước khi biến mất hoàn toàn 4 năm sau đó. CATPHCM đoạt Cúp quốc gia 2001 thì đến năm 2003 chuyển thành NHĐA giành ngôi á quân Cúp quốc gia 2003 để rồi 2 năm sau cũng bị giải tán.
Cách đây 3 năm, sau khi đánh bại nhà vô địch V-League SLNA trong trận chung kết, N.SG giành chiếc Cúp quốc gia 2011, nhưng chỉ 1 năm sau đó do khủng hoảng kinh tế đã buộc phải chia tay V-League. Còn SG.XT sau khi đăng quang ở Cúp quốc gia 2012 cũng bất ngờ bỏ dở V-League 2013 khi mùa giải chỉ còn 2 vòng đấu nữa là kết thúc và bị đánh tụt xuống hạng Ba.
Câu chuyện tương tự diễn ra với các đội bóng của Thủ đô Hà Nội sau khi đoạt Cúp quốc gia. 2 đại diện của bóng đá Hà Nội từng đoạt Cúp quốc gia là HP.HN (năm 2006) và HN.ACB (năm 2008) sau đó nối tiếp nhau giải thể. CLB BĐ HN được hình thành trên cơ sở sáp nhập giữa 2 đội bóng HN.ACB và HP.HN cũng chỉ tồn tại đúng 1 năm rồi giải tán sau khi bầu Kiên vướng vào vòng lao lý.
Một trường hợp khác là Bình Định. Sau 2 năm liên tiếp đoạt Cúp quốc gia 2003, 2004, thành tích của đội bóng đất võ dần dần đi xuống. Kết thúc V-League 2008, Bình Định cùng với HP.HN và HN.ACB đứng cuối bảng và phải xuống chơi ở giải hạng Nhất 2009. 5 mùa liên tiếp không thể thăng hạng, đầu mùa giải 2014 do không đủ kinh phí để duy trì đội bóng, bóng đá Bình Định lần đầu tiên trong lịch sử không còn hiện diện trên bản đồ bóng đá Việt Nam.
Tuy không đến mức bị giải thể như Bình Định nhưng tình cảnh của bóng đá Nam Định cũng không khá hơn là mấy. Sau khi đoạt Cúp quốc gia 2007, bóng đá thành Namg sa sút dần khi hàng loạt cầu thủ trụ cột ra đi. Để rồi sau đó người hâm mộ bóng đá Nam Định phải chứng kiến tình cảnh đội bóng con cưng của mình tụt hạng 2 năm liên tiếp 2010, 2011 từ hạng chuyên nghiệp xuống hạng Nhì, và kể từ đó đến nay vẫn chưa một lần trở lại.
Năm nay, đội đoạt Cúp quốc gia 2013 V.Ninh Bình đang khởi đầu mùa giải 2014 một cách khá kém cỏi: thủ hòa Đồng Nai 2-2 trong trận mở màn và chịu thua 1-3 trước tân binh Than Quảng Ninh ngay trên sân nhà ở vòng đấu thứ 2. Sự khởi đầu kém cỏi đó khiến người ta không khỏi liên tưởng đến số phận hẩm hiu của các đội đoạt Cúp quốc gia trong quá khứ.