Bộ trưởng Phạm Bình Minh khẳng định Việt Nam coi Nhật Bản là một trong những đối tác chiến lược hàng đầu của Việt Nam. Bộ trưởng Gemba Koichiro nhấn mạnh quyết tâm của Nhật Bản thúc đẩy quan hệ đối tác chiến lược với Việt Nam ngày càng mạnh mẽ, phát triển toàn diện trên mọi lĩnh vực và Nhật Bản cam kết sẽ hợp tác trong xây dựng, triển khai chiến lược phát triển công nghiệp của Việt Nam.
Về những diễn biến gần đây trên biển, hai bên nhất trí các bên liên quan cần thông qua đối thoại hòa bình giải quyết ổn thỏa các tranh chấp tại Biển Đông trên cơ sở luật pháp quốc tế, nhất là Công ước Liên hợp quốc về Luật biển năm 1982, tuân thủ nghiêm túc tinh thần DOC và tiến tới xây dựng Bộ Quy tắc ứng xử tại Biển Đông (COC), đồng thời khẳng định sẽ phối hợp chặt chẽ vào những nỗ lực chung, đóng góp thiết thực vào việc duy trì an ninh, an toàn hàng hải và hòa bình, ổn định tại khu vực.
Tại cuộc họp lần thứ 4 của Ủy ban hợp tác Việt Nam – Nhật Bản, Bộ trưởng Gemba Koichiro khẳng định Nhật Bản tiếp tục coi Việt Nam là một đối tác hàng đầu về ODA và Chính phủ Nhật Bản tiếp tục duy trì ODA ở mức cao cho Việt Nam, tập trung vào các lĩnh vực như hỗ trợ tăng trưởng và tăng cường năng lực cạnh tranh, phòng chống thiên tai, ứng phó thảm họa, hoàn thiện thể chế kinh tế thị trường.
Hai bên cũng nhất trí sẽ tiếp tục hợp tác triển khai hiệu quả các thỏa thuận giữa Lãnh đạo cấp cao hai nước, đặc biệt là các dự án phát triển hạ tầng cơ sở lớn như đường bộ cao tốc Bắc - Nam, cảng Lạch Huyện, sân bay Long Thành, các dự án hợp tác kinh tế trọng điểm như xây dựng nhà máy điện hạt nhân Ninh Thuận 2, khai thác và chế biến đất hiếm.
Nhân dịp này, hai Bộ trưởng đã công bố logo sử dụng chung cho các hoạt động kỷ niệm trong Năm hữu nghị Việt - Nhật vào năm 2013, nhân dịp kỷ niệm 40 năm ngày thiết lập quan hệ ngoại giao hai nước. Bộ trưởng Phạm Bình Minh đã thông báo việc Chính phủ Việt Nam quyết định thành lập Ban chỉ đạo các hoạt động kỷ niệm Năm Hữu nghị Việt Nam - Nhật Bản 2013 do Phó Thủ tướng Hoàng Trung Hải đứng đầu.