Vì chấn thương sụm chêm đầu gối, Tuấn Anh đã bỏ lỡ AFF Cup 2016 và sau đó được đưa sang Singapore điều trị. Vì thể trạng và cơ địa không thực sự tốt nên thay vì chỉ cần tiêm thuốc giảm đau và nghỉ ngơi, Tuấn Anh đã được bác sĩ Tan Jee Lim tiến hành tiểu phẫu vào ngày 15/12 vừa qua.
Dự kiến ban đầu Tuấn Anh sẽ cần ít nhất 2 tháng nghỉ mới có thể tập luyện trở lại. Hiện tại, quá trình hồi phục của tiền vệ này diễn tiến khá chậm bất chấp việc anh rất tích cự luyện tập phục hồi trong phòng gym, bơi, đạp xe để duy trì thể lực.
Thế nên nhiều khả năng, Tuấn Anh sẽ cần nghỉ ít nhất 3-6 tháng để trở lại. Bên cạnh đó với tiền sử chấn thương khá nhiều và nặng của tiền vệ này, phía HAGL cũng không vội vàng và mạo hiểm để anh ra sân thi đấu khi chưa hoàn toàn khỏe mạnh. Thế nên nhiều khả năng, Tuấn Anh sẽ không thi đấu ở nửa đầu mùa giải V.League 2017.