Ngày 20/3, ngọn lửa Olympic rước từ Hy Lạp trên một chuyến bay đặc biệt đã đến Nhật Bản một cách lặng lẽ hơn thông lệ. Hai cựu vận động viên Olympic Nhật Bản Saori Yoshida và Tadahiro Nomura đã đưa ngọn lửa từ máy bay đến một cái vạc có hình hoa anh đào trên sân khấu. Không có cảnh chào đón ngọn lửa bởi 200 trẻ em địa phương vì lo ngại virus lây nhiễm.
Sau bài phát biểu của trưởng ban tổ chức Yoshiro Mori, ngọn đuốc đã thắp sáng trên đài lửa Olympic. Giám đốc điều hành Tokyo 2020 Toshiro Muto cho biết: "Việc tiếp sức và thắp sáng đài lửa Olympic là sự kiện lớn nhất trước Thế vận hội. Điều này rất quan trọng đối với chúng tôi là thực hiện nó bằng bất cứ giá nào".