Các bị can bị bắt gồm: Đỗ Quốc Khánh, nguyên Tổng giám đốc và Bùi Văn Viện, nguyên Phó Tổng giám đốc Công ty Cổ phần vận tải dầu khí Việt Nam, thuộc Tổng công ty Vinalines; Phạm Văn Đoàn, Giám đốc công ty trách nhiệm hữu hạn Hợp Thủy về tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ” theo Điều 281 Bộ luật hình sự nước CHXHCN Việt Nam.
Trước đó, Cục Cảnh sát điều tra tội phạm về tham nhũng đã khởi tố, bắt tạm giam Nguyễn Thế Ngọc, nguyên kế toán trưởng Xí nghiệp trực thuộc công ty Cổ phần vận tải dầu khí Việt Nam về tội tham ô tài sản. Hiện vụ án vẫn đang tiếp tục được điều tra mở rộng.