Bệnh viện phụ sản thành phố Cần Thơ thành lập trên cơ sở chia tách Bệnh viện đa khoa thành phố Cần Thơ. Bệnh viện mới này có 11 khoa lâm sàng, 5 khoa cận lâm sàng, 5 phòng chức năng và 1 Trung tâm sàng lọc, chẩn đoán trước sinh và sơ sinh với 288 biên chế.
Bệnh viện phụ sản thành phố Cần Thơ sẽ đáp ứng nhu cầu khám, chữa bệnh, tư vấn về sản phụ khoa và là tuyến cao nhất của thành phố Cần Thơ tiếp nhận những trường hợp sản phụ khoa từ tuyến dưới và các địa phương trong khu vực Đồng bằng sông Cửu Long. Ngoài ra, bệnh viện còn đảm nhận khám, điều trị nhi khoa và sơ sinh nhằm giảm tải cho Bệnh viện Nhi đồng Cần Thơ.
Việc đưa vào hoạt động Bệnh viện phụ sản tại trung tâm khu vực Đồng bằng sông Cửu Long sẽ giúp sản phụ và trẻ em dễ dàng tiếp cận với dịch vụ chăm sóc sức khỏe hiện đại, đồng thời người dân cũng tiết kiệm chi phí bởi họ không cần phải lên đến các bệnh viện tuyến trên ở thành phố Hồ Chí Minh.