Chỉ thị yêu cầu các Bộ, ngành và địa phương lập kế hoạch đầu tư công trung hạn 5 năm từ 2016-2020 nhằm thực hiện các mục tiêu, định hướng phát triển tại các Chiến lược, Kế hoạch phát triển kinh tế - xã hội phù hợp với khả năng cân đối nguồn vốn đầu tư công; tập trung bố trí vốn đầu tư công để hoàn thành và đẩy nhanh tiến độ thực hiện chương trình, dự án quan trọng quốc gia. Đồng thời không bố trí vốn cho chương trình, dự án không thuộc lĩnh vực
đầu tư công.
Trong Chỉ thị, Thủ tướng cũng yêu cầu các Bộ, ngành và địa phương phấn đấu thanh toán các khoản
nợ đọng xây dựng cơ bản đến hết ngày 31/12/2014. Từ năm 2015 trở đi, các cấp, các ngành phải quán triệt và thực hiện nghiêm các quy định của Luật Đầu tư công, không để phát sinh thêm nợ đọng xây dựng cơ bản. Nếu để phát sinh các khoản nợ đọng xây dựng cơ bản từ 1/1/2015, các Bộ, ngành và địa phương bị xử lý vi phạm theo các quy định của Luật Đầu tư công.
Tại Chỉ thị, Thủ tướng Chính phủ cũng yêu cầu không xé lẻ vốn cho nhiều chương trình, giai đoạn 2016-2020 chỉ thực hiện hai chương trình mục tiêu Quốc gia là Chương trình mục tiêu Quốc gia Giảm nghèo bền vững và Chương trình mục tiêu Quốc gia xây dựng nông thôn mới. Đối với các chương trình mục tiêu Quốc gia, chương trình mục tiêu giai đoạn 2011-2015 không tiếp tục thực hiện trong giai đoạn 2016-2020, các Bộ, ngành, địa phương tập trung chỉ đạo để hoàn thành dứt điểm đưa vào sử dụng các dự án đầu tư dở dang, không mở thêm các dự án đầu tư mới.