Theo Hiệp hội chế biến xuất khẩu thủy sản Việt Nam (VASEP), đối với ngành thủy sản của Việt Nam, EU là một trong ba thị trường tiêu thụ lớn nhất. Xuất khẩu thủy sản sang khu vực này chiếm gần 18% tổng giá trị xuất khẩu thủy sản của cả nước. Trong đó, tôm là mặt hàng có giá trị xuất khẩu lớn nhất.
Năm 2013, xuất khẩu thủy sản sang EU đạt trên 1,18 tỷ USD, trong đó, xuất khẩu tôm đạt 409 triệu USD, xuất khẩu cá tra đạt 385,4 triệu USD. Đối với tôm, EU là thị trường tiêu thụ lớn thứ ba sau Mỹ và Nhật Bản. Năm 2013, xuất khẩu tôm sang thị trường này hồi phục đáng kể sau hơn một năm giảm sâu do ảnh hưởng của khủng hoảng kinh tế.