Theo kết quả nghiên cứu công bố mới nhất của Viện Sinh thái học và Tiến hóa, Viện Hàn lâm Khoa học Nga, Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga tại Nha Trang và Viện Hải dương học trên tạp chí Marine and Freshwater Research- 90% diện tích rạn san hô phong phú và khỏe mạnh ở vịnh Nha Trang đã biến mất so với những năm năm 1980, giảm từ 6,65km2 trước năm 1980 xuống còn 0,74km2 vào năm 2019, trong đó giai đoạn hiện nay là suy giảm mạnh nhất, đáng báo động. Điều đó cho thấy, Nha Trang đã mất 90% san hô trong vòng chưa đầy 40 năm. Việc mất đi rạn san hô đã gây ra sự đứt gãy sinh thái rất lớn, thậm chí gây khủng hoảng cho cả hệ sinh thái ở vịnh vì “san hô chính là mái nhà, đi kèm với nó là các quần xã sinh vật biển”.