Với sự tham gia trực tuyến của Sở chỉ huy Bộ Quốc phòng và 31 điểm cầu truyền hình trong toàn quân, Bộ trưởng Phùng Quang Thanh đã giao nhiệm vụ cụ thể cho các cơ quan, đơn vị lực lượng phòng chống bão, tìm kiếm cứu nạn trong toàn quân, Quân chủng Hải quân, Quân chủng Phòng không không quân, Bộ Tư lệnh Bộ đội biên phòng, Bộ Tư lệnh Cảnh sát biển, các đơn vị quân đội đóng quân từ Quân khu 3 trở vào tập trung toàn lực phòng chống bão số Haiyan hiệu quả, trực 24/24, chuẩn bị sẵn phương án khi bão bất ngờ đổi hướng.
Bộ trưởng yêu cầu các đơn vị dừng các cuộc họp, hội nghị, hoạt động chưa cần thiết, dừng huấn luyện trong những ngày bão đổ bộ. Quân chủng Hải quân tổ chức sơ tán, di dời bộ đội và nhân dân ở quần đảo Trường Sa, nhà giàn DK1, các đảo gần bờ; hỗ trợ địa phương sơ tán, di dời dân tránh bão, Bộ Tư lệnh thông tin liên lạc, Tập đoàn viễn thông quân đội Viettel có các phương án bảo đảm thông tin thông suốt trong mọi tình huống.
Toàn quân tập trung toàn lực cùng với các bộ ngành, địa phương và toàn thể nhân dân chống bão Haiyan, giảm thiểu thấp nhất thiệt hại về người và tài sản.