Mục tiêu của Kế hoạch là từng bước kiểm soát, khống chế không để dịch lây lan trên diện tích, chủ động xây dựng vùng an toàn dịch cúm gia cầm. Từ đó, tạo nền tảng để chuyển sang giai đoạn thanh toán cúm gia cầm độc lực cao tại Việt Nam từ năm 2018.
Trong đó, mục tiêu cụ thể là tập trung khống chế, giảm tỷ lệ các vùng có nguy cơ cao: đến năm 2015, cả nước có 60% tỉnh, thành chuyển sang vùng nguy cơ dịch thấp và đến năm 2018, con số đó đạt 80%. Các tỉnh Đông Nam Bộ sẽ sạch cúm gia cầm H5N1 vào năm 2018.
Ngân sách TƯ dành thực hiện kế hoạch trong 5 năm là hơn 132 tỷ đồng.