Theo quy định hiện hành, các sản phẩm nông, thủy sản xuất khẩu đều được miễn thuế VAT, nhưng doanh nghiệp phải nộp thuế trước và chỉ được hoàn thuế sau khi đã xuất khẩu nông sản đi.
Theo các doanh nghiệp kinh doanh nông sản, việc miễn luôn thuế VAT sẽ giúp cho cả doanh nghiệp và nhà nước tiết kiệm được nhiều thời gian hơn trong khâu thủ tục nộp và hoàn thuế VAT. Bên cạnh đó, cũng tránh được tình trạng doanh nghiệp lợi dụng khe hở của chính sách, thành lập doanh nghiệp "ma" để trục lợi từ việc hoàn thuế VAT.
Tuy nhiên, hiện nay, điều khiến doanh nghiệp còn băn khoăn, đó là định nghĩa nông sản thô còn khá mập mờ.