Trong kết luận thanh tra toàn diện việc cổ phần hóa Cảng Quy Nhơn, Thanh tra Chính phủ đã chỉ ra nhiều sai phạm liên quan đến UBND tỉnh Bình Định và Bộ Giao thông vận tải (Bộ GTVT). Đặc biệt Bí thư tỉnh ủy Bình Định có văn bản vào năm 2015 đề nghị Bộ GTVT đẩy nhanh tiến độ bán toàn bộ 49% cổ phần của Nhà nước tại công ty cổ phần Cảng Quy Nhơn là "không đúng chức năng, nhiệm vụ theo quy định của pháp luật, không đúng với Đề án tái cơ cấu Vinalines".
Bên cạnh đó, Bộ GTVT được xác định chưa làm đúng chức năng nhiệm vụ và có những vi phạm khi đề xuất chuyển nhượng hết 49% vốn điều lệ tại công ty CP Cảng Quy Nhơn không đúng với đề án đã được phê duyệt, chỉ đạo về phương thức chuyển nhượng vốn không rõ ràng, thiếu nhất quán. Kết luận của TTCP cũng nêu rõ UBND tỉnh Bình Định đã có những "ưu ái" đặc biệt khi giao đất cho công ty TNHH MTV Cảng Quy Nhơn và công ty CP Cảng Quy Nhơn.
Trước những khuyết điểm, vi phạm nêu trên, Tổng TTCP kiến nghị Thủ tướng giao Bộ GTVT chủ trì, chỉ đạo, thực hiện việc thu hồi khoảng 75% cổ phần tại công ty CP Cảng Quy Nhơn về sở hữu Nhà nước, vì Bộ GTVT đã cho phép Vinalines chuyển nhượng cho công ty Hợp Thành theo phương thức thỏa thuận trực tiếp trái thẩm quyền.
Thanh tra kiến nghị Thủ tướng chỉ đạo xử lý trách nhiệm đối với các tập thể, cá nhân liên quan đến các vi phạm, khuyết điểm, đồng thời sẽ chuyển kết luận thanh tra đến Ủy ban Kiểm tra trung ương để xem xét, xử lý theo thẩm quyền đối với những cán bộ thuộc diện Bộ Chính trị, Ban Bí thư quản lý. Đây cũng là mong mỏi của nhiều cán bộ đảng viên và nhân dân tỉnh Bình Định.
Một kết luận thanh tra thứ 2 được Thanh tra Chính phủ công bố trong tuần qua cũng thu hút sự quan tâm của dư luận là kết luận thanh tra việc cổ phần hóa Hãng phim truyện Việt Nam. Đây là cuộc thanh tra đột xuất được thực hiện sau khi có nhiều phán ảnh trái chiều từ Hội điện ảnh Việt Nam, từ cán bộ, nhân viên hãng phim.
Theo Thanh tra Chính phủ, khi thực hiện cổ phần hóa, trong quá trình xây dựng phương án sử dụng đất công ty TNHH MTV Hãng phim truyện Việt Nam đã đưa ra cả những lô đất chưa được cấp có thẩm quyền phê duyệt là sai quy định. Phương án sử dụng đất chưa hoàn thiện nhưng BỘ VHTT&DL đã phê duyệt chuyển thành công ty cổ phần là không đúng với quy định về cổ phần hóa. Bộ này cũng chưa xác định được giá trị thương hiệu cụ thể của hãng phim…
Thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo Bộ VHTTDL xây dựng kế hoạch và tổ chức thực hiện ngay các quy trình thủ tục để nhà đầu tư chiến lược là Tổng công ty vận tải Thủy xin rút vốn trước thời gian, đồng thời, chủ trì làm việc với nhà đầu tư mới đáp ứng đầy đủ các điều kiện theo quy định và các đơn vị có liên quan thực hiện các quy trình, thủ tục tiếp nhận và chuyển giao Hãng phim truyện Việt Nam.