Công việc này sẽ do 2 Trung tâm kiểm định chất lượng giáo dục của hai trường Đại học Quốc gia Hà Nội và TP.HCM thực hiện. Ngoài 60 trường Đại học, 2 trung tâm nói trên còn thực hiện kiểm định 15 trường Cao đẳng và 95 chương trình đào tạo.
Theo Bộ Giáo dục và Đào tạo, đây là năm đầu tiên, 2 trung tâm này thực hiện kiểm định nên số lượng các trường và cơ sở kiểm định chưa nhiều. Những năm tiếp theo, tốc độ kiểm định sẽ được đẩy mạnh. Bộ Giáo dục và Đào tạo cũng khuyến khích các cơ sở giáo dục Đại học áp dụng các tiêu chuẩn kiểm định quốc tế, khu vực ASEAN, lựa chọn tổ chức kiểm định được Bộ GD&ĐT cho phép để đăng ký kiểm định.