Theo Thông tư, chế độ tài chính của Công ty VAMC thực hiện theo quy định của pháp luật đối với Công ty trách nhiệm hữu hạn một thành viên do Nhà nước nắm giữ 100%
vốn điều lệ.
Vốn hoạt động của VAMC bao gồm vốn đầu tư của chủ sở hữu và vốn huy động. Trong đó, vốn đầu tư của chủ sở hữu gồm: vốn điều lệ 500 tỷ đồng và các nguồn vốn khác. Vốn huy động là trái phiếu đặc biệt do VAMC phát hành và các nguồn vốn khác.
Để mua các khoản nợ xấu theo giá trị thị trường, VAMC được sử dụng các nguồn vốn hợp pháp ngoại trừ trái phiếu đặc biệt.
Đáng lưu ý là VAMC chỉ được sử dụng vốn để đầu tư ra ngoài dưới các hình thức như gửi tiền tại các ngân hàng thương mại nhà nước; Tham gia góp vốn, mua cổ phần doanh nghiệp theo quy định.
Thông tư này có hiệu lực thi hành từ ngày 15/2/2014.