Theo khảo sát, tại Phú Yên, hiện có đến 50 loại giống lúa được gieo trồng, phần lớn trong số đó do nông dân tự để giống hoặc tự trao đổi giống lúa lẫn nhau. Như vậy, giống lúa nhiều nhưng việc kiểm soát chất lượng lại hầu như phụ thuộc vào khả năng lựa chọn của nông dân.
Thực tế ở tỉnh Phú Yên cũng là tình trạng chung ở hầu khắp các vùng sản xuất lúa trên cả nước. Các nhà khoa học cho rằng, đây là biểu hiện của tình trạng loạn lúa giống, gây nhiều bất lợi đối với nông dân trong quá trình sản xuất.
Ngành Nông nghiệp cần sát sao trong việc khuyến cáo nông dân sử dụng những giống lúa phù hợp. Muốn vậy, việc khảo nghiệm, xây dựng bộ giống lúa cho các cánh đồng cần phải được thực hiện nhanh, để sớm đưa ra khuyến cáo cho người nông dân.