Theo tuyên bố của thủ lĩnh al-Qaeda, mạng lưới này không có liên hệ với “Nhà nước hồi giáo Iraq và Cận Đông” ISIL. Nhóm này không phải là một nhánh của al-Qaeda và al-Qaeda không chịu trách nhiệm trước những hoạt động của ISIL.
Hồi tháng 5/2013, thủ lĩnh al-Qaeda al-Zawahiri đã ra lệnh giải tán nhóm ISIL và yêu cầu trở về Iraq, đồng thời tuyên bố nhóm thánh chiến Hồi giáo khác, Mặt trận al-Nusra, là nhánh chính thức của al-Qaeda tại quốc gia đang chìm trong chiến tranh Syria.
ISIL hiện có nhiều tay súng đang tham gia các cuộc đụng độ đẫm máu với phiến quân ở Syria.