Tổ hợp môn thi khoa học tự nhiên đều thi theo hình thức trắc nghiệm. Tại tỉnh Phú Yên, số thí sinh vắng thi là 85 thí sinh, tập trung chủ yếu ở hệ giáo dục thường xuyên. Tình hình an ninh trật tự phòng thi được đảm bảo tại 25 điểm thi. Về đề thi, nhiều thí sinh khẳng định đề thi năm nay rất khó được điểm cao vì tương tự hai môn Toán và Ngữ văn, đề thi có nhiều câu hỏi dạng phân hóa cao. Học sinh có lực học trung bình đến trung bình khá ít cơ hội đậu vào các trường đại học ở tốp giữa. Phần câu hỏi dành để xét tốt nghiệp, phần lớn thí sinh cho biết đều nắm chắc đạt 5 điểm trở lên.
Do thời tiết ở Phú Yên có nắng nóng nên các đội hình "Tiếp sức mùa thi" đã vận động được 12.000 chai nước uống, 3.000 quạt cầm tay, 50 chỗ trọ miễn phí, 1.200 hộp sữa, 200 suất cơm trưa miễn phí…Ngoài việc cấp phát nước miễn phí cho thí sinh và người nhà, các tình nguyện viên còn phối hợp cùng các cơ quan chức năng tổ chức trực, hướng dẫn phân luồng giao thông, giảm ùn tắc giao thông tại các điểm thi.
Do là môn thi không phải là bắt buộc nên tại cụm thi Đà Nẵng số lượng thí sinh tham gia dự thi giảm hơn 1 nữa so với ngày thi đầu tiên, có 46 thí sinh vắng không dự thi. Chiều nay, các thí sinh dự thi môn Ngoại ngữ. Đây cũng là môn thi cuối cùng của kỳ thi trung học phổ thông quốc gia đối với các thí sinh chỉ dự thi bài thi khoa học tự nhiên.
Còn tại Tây Nguyên, hôm nay thời tiết khá thuận lợi cho việc tổ chức kỳ thi THPT quốc gia năm 2018. Theo tổng hợp đánh giá của Hội đồng, công tác tổ chức kỳ thi tại các tỉnh Tây Nguyên được tổ chức khá chu đáo, nghiêm túc, chưa có sự cố đáng tiếc nào xảy ra; các thí sinh tiếp tục bước vào ngày thi thứ 2 với tổ hợp môn thi khoa học tự nhiên, thời gian làm bài mỗi môn thi là 50 phút theo hình thức trắc nghiệm. Đây là năm thứ 2 bài thi tổ hợp xuất hiện tại kỳ thi THPT quốc gia. Vì thí sinh phải thi 3 môn trong một buổi, thời gian nghỉ giữa các môn chỉ có 10 phút thay vì 20 phút như năm 2017 do vậy khiến thí sinh khá vất vả. Theo nhận định, không chỉ học sinh mà hầu hết giáo viên đều đánh giá đề thi tổ hợp các môn Khoa học tự nhiên năm nay khá khó mang tính phân loại cao. Học sinh phải học thật bao quát, nắm vững kiến thức ở lớp 11 và 12 thì mới đạt được điểm cao.
Thống kê của Bộ GD-ĐT, trong sáng nay có gần 350.000 thí sinh đăng ký bài thi khoa học tự nhiên. Ngoài ra, còn có một tỉ lệ nhất định thí sinh dự thi các môn thi thành phần của bài thi tổ hợp, số này là thí sinh tự do thi để xét tuyển ĐH, CĐ hoặc thí sinh tự do thi để xét công nhận tốt nghiệp THPT có bảo lưu các môn thành phần của bài thi tổ hợp của năm 2017.