Thí điểm chương trình phục hồi chức năng dựa vào cộng đồng, Bộ Y tế thực hiện chuyển giao kỹ thuật phục hồi chức năng cho cán bộ y tế tuyến huyện và xã, đảm bảo tuyến cơ sở có thể chủ động giúp người khuyết tật tập, phục hồi chức năng ngay tại trạm hoặc tại nhà mà không phải lên tuyến trên, gây khó khăn và tốn kém cho người bệnh như hiện nay. Phú Yên là địa phương duy nhất tại khu vực Nam Trung bộ được Bộ Y tế chọn triển khai chương trình này trong năm 2018.
Bệnh viện phục hồi chức năng tỉnh Phú Yên là đơn vị được chọn thí điểm bởi đã thực hiện được hầu hết kỹ thuật phục hồi chức năng cho bệnh nhân, cả do dị tật bẩm sinh hoặc tai biến, chấn thương gây mất khả năng lao động. Một số kỹ thuật mới như điều trị di tật bàn chân khoèo, hội chứng ống cổ tay, hội chứng bàn tay bật…cũng được bệnh viện điều trị tốt. Không chỉ người khuyết tật trong tỉnh mà bệnh nhân một số tỉnh lân cận cũng đến điều trị tại đây. Bình quân, mỗi ngày có 250 bệnh nhân điều trị nội trú, gấp đôi chỉ tiêu giường bệnh của bệnh viện.