Việc tổ chức đấu giá để cấp phép quyền khai thác khoáng sản tại Quảng Ngãi tuy đã khắc phục những tiêu cực đối với cơ chế xin- cho nhưng vẫn chưa đạt yêu cầu đề ra. Công tác quản lý khai thác tài nguyên khoáng sản sau cấp phép vẫn còn những lỗ hổng.
Hoạt động khai thác khoáng sản cũng khiến nhiều tuyến giao thông xuống cấp, gia tăng tình trạng ô nhiễm môi trường, tiềm ẩn nguy cơ mất an toàn giao thông ở nhiều tuyến đường đô thị, nông thôn trên địa bàn tỉnh Quảng Ngãi.