Theo cáo trạng của Viện kiểm sát tỉnh Quảng Ngãi, trong vài năm trở lại đây, Đinh Diêm là mục sư tự phong của Hội thánh Tin Lành Lutharan Việt Nam - Hoa Kỳ; đã móc nối, tham gia tổ chức "Chính phủ quốc gia Việt Nam lâm thời" – một tổ chức khủng bố, có trụ sở đặt tại Mỹ chuyên tiến hành các hoạt động kích động khủng bố, phá hoại nhằm lật đổ chính quyền nhân dân. Quá trình điều tra, cơ quan chức năng đã thu được nhiều tài liệu liên quan hoạt động phạm tội của Đinh Diêm.
Hội đồng xét xử đã tuyên phạt bị cáo Đinh Diêm 16 năm tù giam
Đinh Diêm được Đào Minh Quân tự phong là "Thủ tướng Chính phủ quốc gia Việt Nam lâm thời" bổ nhiệm chức vụ "Chủ tịch lâm thời Hội đồng liên tôn tại Việt Nam". Từ đây Đinh Diêm ra sức vận động, kêu gọi một số chức sắc tôn giáo tham gia vào tổ chức phản động này, nhằm mục đích phát triển lực lượng, tiến hành hoạt động lật đổ chế độ...
Trước đây Đinh Diêm từng tham tổ chức phản động Fulro và bị bắt đưa đi cải tạo. Tại phiên tòa, Hội đồng xét xử đã tuyên phạt bị cáo Đinh Diêm 16 năm tù giam.