Đoạn sông Tam Kỳ chảy qua thôn Phú Tân xã Tam Xuân 1, huyện Núi Thành. Dù chỉ mới có một cơn mưa lớn vào tối hôm trước song vài chục mét phía bờ nam đã bị sạt lở. Theo người dân trong thôn, cứ mỗi năm nước cuốn trôi vài ba mét khiến cho khu đất trong làng ngày càng bị thu hẹp uy hiếp nghiêm trọng đến khu vực dân cư.
Không chỉ riêng thôn Phú Tân, dọc sông Tam Kỳ đến sông Trường Giang, nhiều khu vực bờ sông bị sạt lở, xâm thực cả vào vườn cây và tuyến giao thông ven thôn. Tình trạng này đã diễn ra nhiều năm trước nhưng chính quyền địa phương vẫn chưa có phương án tài chính để xây dựng kè bao bảo vệ bờ sông.
Vùng hạ lưu sông Tam Kỳ hàng năm đều chịu ảnh hưởng bởi lũ lụt, hơn nữa đây là vùng đất có nền địa chất yếu. Ngoài việc ảnh hưởng xả lũ của Hồ Phú Ninh thì việc khai thác cát bừa bãi và làm đìa tôm lấn sông cũng là nguyên nhân gây ra sạt lở ở đoạn sông này.
