Các Chi hội nghề cá là tổ chức được giao quyền khai thác và quản lý mặt nước trên thủy vực xung quanh các khu bảo vệ thủy sản. Song song với đó, mọi người có nhiệm vụ tuần tra, kiểm soát để ngăn chặn tình trạng khai thác hủy diệt, đánh bắt trái phép trên đầm phá. Việc tham gia của cộng đồng trong công tác bảo vệ và tái tạo nguồn lợi thủy sản ở vùng ven phá, ven biển miền Trung trong thời gian qua được đánh giá là đạt hiệu quả cao, góp phần phục hồi  nhiều loài hải sản sau những tổn thất bởi sự cố môi trường và hoạt động đánh bắt trái phép mang tính hủy diệt. Tuy nhiên khó khăn lớn mà các Chi hội nghề cá địa phương đang gặp phải hiện nay là không có kinh phí để hoạt động.

Từ năm 2009 đến nay, tỉnh Thừa Thiên Huế đã lần lượt thành lập được 23 khu bảo vệ thủy sản, và giao quyền khai thác cho các tổ chức ngư dân tham gia giữ gìn, tái tạo nguồn lợi thủy sản. Có thể nói, các tổ chức này là những cánh tay nối dài hỗ trợ đắc lực cho các cơ quan chức năng. Và để hoạt động này thực sự phát huy hiệu quả, không mang tính hình thức cần có chính sách hỗ trợ kinh phí, để quyền lợi và nghĩa vụ luôn song hành, hiệu quả mang lại sẽ bền vững hơn.