Trạm BOT Bến Thủy là trạm thứ 15,16 trong tổng số 28 trạm trong dự án thu giá không dừng trên Quốc lộ 1 và đường Hồ Chí Minh qua Tây Nguyên được vận hành theo hình thức thanh toán điện tử. Với việc áp dụng công nghệ thu phí tự động tại trạm BOT Bến Thủy, Nghệ An là địa phương thứ 2 trong cả nước (sau Quảng Bình) hoàn toàn thu phí không dừng tại các trạm BOT trên địa bàn. Đồng thời, các phương tiện có thẻ VETC sẽ thông tuyến không dừng khi đi qua các trạm BOT trên toàn bộ địa bàn Bắc Trung bộ. 

Với lượng qua trạm bình quân hơn 1 vạn phương tiện mỗi ngày (trong đó hơn 5000 phương tiện được miễn phí), giải pháp thay thế hình thức thu tiền thủ công này được nhận định sẽ giải quyết triệt để các vấn đề về ùn tắc giao thông, lãng phí nguồn nhân lực tại các trạm thu phí. Đặc biệt, giúp các cơ quan quản lý nhà nước minh bạch hóa công tác thu phí của nhà đầu tư BOT.