Sở Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn là đơn vị chủ trì, phối hợp các cơ quan liên quan tổ chức kiểm tra, rà soát toàn bộ các hồ chứa trên địa bàn nhằm xử lý, khắc phục ngay những công trình, hạng mục công trình hư hỏng có nguy cơ mất an toàn. Đối với các công trình đang thi công cần đẩy nhanh tiến độ nhằm bảo đảm cao trình vượt lũ theo quy định, đối với các hồ chứa chưa hoàn thành phải xây dựng phương án ứng phó thiên tai cho công trình.

Tỉnh Phú Yên hiện có 43 hồ chứa thủy lợi, thủy điện với tổng dung tích hơn 70 triệu m3. Ngoài các hồ chứa thủy điện, các hồ chứa thủy lợi đều xây dựng cách đây hơn 20 năm nhưng chưa được đầu tư, sửa chữa đồng bộ nên nhiều hạng mục đã xuống cấp. Do vậy, vấn đề đảm bảo an toàn hồ chứa đang được tỉnh Phú Yên đặc biệt lưu tâm.