Từ năm 2017 đến nay, Cục Thuế Phú Yên đã thực hiện cấp mới 1.203 mã số thuế với thời gian thực hiện thủ tục cấp mã số thuế tại cơ quan thuế rút ngắn tối đa, chỉ còn ít hơn 4 phút. Trong đó, để tạo thuận lợi cho doanh nghiệp, cơ quan thuế đã phối hợp với Phòng Đăng ký kinh doanh (Sở Kế hoạch Đầu tư Phú Yên) triển khai cấp mã số thuế cho hơn 500 doanh nghiệp qua Cổng thông tin đăng ký doanh nghiệp của Sở này.
Hiện ngành thuế thực hiện đồng bộ, đơn giản hóa nhiều chính sách và thủ tục hành chính về thuế cho doanh nghiệp với việc giảm số lần khai thuế, nộp thuế GTGT cho các doanh nghiệp từ 12 lần/năm xuống còn 4 lần/năm.