Thực hiện chương trình "Bảo vệ thành quả thanh toán bại liệt ở Việt Nam giai đoạn 2016 - 2020", Bộ Y tế đang triển khai tiêm 1 mũi vắc-xin bại liệt trong chương trình tiêm chủng mở rộng trong cả nước. Do lượng vắc-xin Tổ chức Liên minh toàn cầu về vắc-xin và tiêm chủng (GAVI) hỗ trợ cho Việt Nam chưa đủ tiêm cho toàn bộ trẻ dưới 1 tuổi nên vắc-xin bại liệt hiện chỉ được tiêm cho trẻ đủ 5 tháng tuổi tại thời điểm triển khai.
Vì mỗi lọ vắc-xin chứa 10 liều nhưng số trẻ đủ 5 tháng tuổi tại mỗi xã phường lại không nhiều nên ngành y tế tỉnh Phú Yên đã tổ chức tập trung trẻ của nhiều xã tại một địa điểm tiêm. Chính vì vậy mà toàn tỉnh có 112 xã phường nhưng có 47 điểm tiêm vắc-xin bại liệt.
Trước đây, trẻ được uống 3 liều vắc-xin phòng bại liệt khi được 2,3 và 4 tháng tuổi. Tuy nhiên, hiện nay, liều uống vắc-xin phòng bại liệt typ 2 bị cắt bỏ trong chương trình tiêm chủng mở rộng, trẻ chỉ còn uống liều vắc-xin bại liệt typ 1 và typ 3. Thay vào đó, Bộ Y tế triển khai tiêm 1 mũi vắc-xin phòng bại liệt để củng cố miễn dịch phòng chống bệnh bại liệt cho trẻ. Trong đợt này, toàn tỉnh Phú Yên có 591 trẻ đủ 5 tháng tuổi được tiêm vắc-xin bại liệt. Theo quy định của Bộ Y tế, những trẻ chưa được tiêm sẽ tiêm bù trong các chiến dịch dự kiến vào 2019.
Cùng với Phú Yên, Điện Biên, Gia Lai, và Vĩnh Long là những địa phương đầu tiên thực hiện tiêm vắc-xin bại liệt cho trẻ trong chương trình tiêm chủng mở rộng trong tháng 6 và 7/2018. Từ tháng 8, chương trình sẽ triển khai trên cả nước.