Theo cáo trạng từ tháng 12/2009 đến tháng 6/2015, nguyên kế toán Vũ Thị Kim Hoa và nguyên thủ quỹ Trịnh Thị Hoa đã cùng nhau lập khống chứng từ thanh toán và trực tiếp lấy tiền quỹ, tiền học phí tiền ăn do nhà nước chi cho học viên các lớp trung cấp lý luận chính trị - hành chính học tại Trường Chính trị Phú Yên, chiếm đoạt hơn 3,2  tỷ đồng.

Sau đó, Trịnh Thị Hoa dùng tiền "âm phủ" loại 500.000 đồng xếp thành xấp rồi dùng tiền thật mệnh giá 500.000 đồng bọc bên ngoài để đối phó khi kiểm tra.

Cáo trạng cũng xác định từ tháng 9/2009 đến 12/2012, Phó hiệu trưởng Lê Văn Sự đã ký duyệt 66 bộ chứng từ thanh toán chế độ tiền ăn cho học viên. Còn Phó hiệu trưởng Nguyễn Thị Tuyết Nga, từ 1/2013 đến 6/2015 cũng ký duyệt 46 bộ chứng từ thanh toán tiền ăn cho học viên. Hai Phó hiệu trưởng này đã thiếu kiểm tra, đối chiếu giữa chứng từ thanh toán so với lịch học của học viên nên không phát hiện kế toán, thủ quỹ lập khống chứng từ.

Nguyên thủ quỹ Trịnh Thị Hoa bị truy tố về tội tham ô tài sản. Riêng Vũ Thị Kim Hoa nguyên kế toán trường Chính trị Phú Yên bị truy tố về 2 tội: tham ô và thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng. Nguyễn Thị Tuyết Nga - Nguyên Phó hiệu trưởng, Lê Văn Sự - nguyên Phó hiệu trưởng trường Chính trị tỉnh Phú Yên bị truy tố tội thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng.